Een terrorist die eerder al voor chaos zorgde in de aflevering 'Bete Noir' heeft nu een nieuw groots plan opgevat: hij heeft het gemunt op de president. Gibbs en zijn team trachten zijn identiteit te achterhalen voor hij zijn plan kan uitvoeren.

Een marinier wordt dood aangetroffen in mysterieuze omstandigheden op de avond van een top secret missie.

Een marinier wordt vermoord door een anti-tank wapen. Het onderzoek leidt het NAVY NCIS team naar een lokale militie.

Een marinier blijkt vermist na een afspraak met een journalist. Tijdens het onderzoek ontdekt het Navy NCIS team dat drie vorige leden van hun eigen team dood zijn. Ze vermoeden dat het hoofd van hun eenheid een seriemoordenaar is.

Een lid van het NCIS team wordt dood teruggevonden. Hij onderzocht op het moment van zijn dood een reeds vergeten zaak. De rest van het NCIS team is diep geschokt en trekt op onderzoek uit.

Het team zoekt naar een ex-gevangene die wraak wil nemen.

Na een wild feest in een illegale nachtclub wordt het lijk van een marinier gevonden. Het team moet uitzoeken wat er juist is fout gegaan. Ze vermoeden dat het gaat om een ongeluk. Maar wanneer er enkele verhalen van afpersing en bedreiging opduiken, moeten ze al snel dieper in de zaak graven.

Ducky, Gerald, en Kate worden gegijzeld door een terrorist. NCIS moet onderzoeken hoe het mogelijk is dat een lid van een terroristische organisatie een baan heeft gekregen op de marinebasis.

Het FBI vraagt Gibbs om zijn voormalige marine-officier op te sporen. Hij zou geld gestolen hebben tijdens een missie in Irak. Maar Gibbs is er van overtuigd dat de man die hem getraind heeft onschuldig is.

Er worden naakte lichamen van jonge mannen gevonden aan de rand van de weg naar Norfolk. Het blijken jonge mariniers te zijn. Wie heeft dit gedaan en vooral wat is het motief van deze brute moordenaar?